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一
皖南战场上的失利，打乱了北洋军全盘部署。段琪瑞清醒地认识到，在后勤保障日益困难的严峻形势下，江南战场已陷入完全被动，整体上将不得不由战略进攻转入战略防御。
于是他采取了一系列应变措施：
收缩战线，将浙江省内兵力集中于以杭州为中心的几处据点，尤以护卫沪杭铁路浙江段（嘉善-杭州）为重。同时向杭州方向增兵，使浙江境内正规部队达到7个整编师，约9万多人。
常州前线调整为12个师（含第五军2个王牌师），不过均因战斗大量减员，约11万人。
上海市郊奉贤、松江一带驻扎了4个师、1个警卫旅，约6万人。
连同各地方卫戍部队，江南北洋军总兵力约28万多人。
这是个两头大中间小，以杭州、上海、常州三座城市为中心构筑的攻防体系。其中常州前线采取攻势；杭州方面采取守势；而上海作为大后方，其驻地部队为战略总预备队。
意图有二：一是缩短补给线，借此抵消部分战略上的被动；二是预防王啸飞的皖南军团向东挺进袭击浙江。三座重镇互为犄角，有利于随战局发展及时应变。
与此同时，南京政府鉴于形势的巨大变化，召开了一场共和国最高军事会议。由孙中山总统亲自主持，陆军部长黄兴、战区司令员石铮以下相关将领参与。
黄兴首先提出，皖南的王啸飞军团如今已拥有16万人马，可集中优势兵力东进攻取杭州，之后配合南京军团反攻上海。
这无疑是个比较成熟的战略构想，若能拔掉杭州这根钉子，如同是扭断了敌人一条臂膀，之后便可从容北上，对苏沪之敌形成两线夹击之势。这个策略说出了多数将领心中所想，纷表赞同之后，顺理成章地讨论起了进攻杭州的具体方案。所持意见大致分为两派。
一种是速战派。认为我军新胜，局部兵力又占优，所以应以主力长驱东进。首先袭取余杭、临安等外围据点，并进占富春江北岸