9－2000赛季，森林狼队取得建队历史上最好的50胜32负，超过了以前的纪录，1997－98赛季创下的45胜37负。这是他们连续第三个胜率过半的赛季，也是连续第四次闯进季后赛。全队表现得相当不错。但是2000年6月之后，森林狼队的曰子就不太好过了。
2000－2001赛季森林狼有些挣扎，他们对球队发生的事情无能为力。上赛季刚刚结束的时候，森林狼队失去了马利克·希利，他不幸在一次车祸中丧生。十月，NBA宣布前锋乔·史密斯和森林狼队的合同无效，这就是臭名昭著的“工资帽丑闻”。当时费根与森林狼队签订了一份远低于史密斯市场价格的伪合同（2年175万美元），然后暗地里又让森林狼许诺两年后给史密斯一个长期顶薪合同（7年8600万美元），好从中收取巨额劳务费。结果此事被NBA官方发现，森林狼遭到重罚，剥夺未来5个赛季首轮选秀权外加高额罚款，而乔·史密斯也被勒令中止合约成为自由人，双方两败俱伤。他之后在十一月和底特律活塞队签约，一年之后又回来了。球队在2000－01赛季迎来了新面孔昌西·比卢普斯、拉方索·埃利斯、雷吉·斯雷特、托德·戴和后来的菲利普·洛佩斯，他们不仅仅生存下来了，而且枝繁叶茂。但是他们输掉了未来，没有首轮选秀权就意味着失去了很多很多东西。即使这样，明尼苏达森林狼依旧很顽强，他们能给NBA联盟的大多数球队带来麻烦，76人要小心了。
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