挺马克沁重机枪（后易MHB型.MM高平两用重机枪）；营部连装备门KK型MM反坦克炮、四挺捷克ZB-轻机枪（后易MG-4、MG-4）。
步兵连辖三步兵排、机炮排、连部，每连约人，机炮排排取消掷弹筒编制，装备三门M型MM迫击炮，三挺捷克式轻机枪（后易MG-4、MG-4）。
步兵排三十人，辖三班，每班十二人，包括一个二人机枪组，一个狙击手，一名班长，一名副班长，七名步兵。二人机枪组装备一挺捷克ZB-轻机枪（后易MG-4、MG-4），副射手使用M冲锋枪，狙击手使用毛瑟K狙击步枪，正副班长使用M冲锋枪，步枪手使用M加兰德步枪，机枪主射手、狙击手、正副班长每人一支M手枪。
这只是上报军事委员会的编制，除此之外，新二军还将统辖两个补充旅、一个教导旅、一个重炮旅、一个辎重旅、一个独立骑兵旅，装甲团、警卫团、装甲侦察团、工兵团、宪兵团、防空团、通信营、军属野院各一个，四个基地守备营以及四个要地防空营。
按照此时国民政府保安团的普遍编制，一个团只有区区数百人，但是这显然满足不了宁志远，在他眼中，保安团可不只是保障地方治安的民团性质部队，而是正儿经的作战部队，主力远征后需要负责西北的安全，如果需要，甚至要随时整编为正规军，走上不久后的抗日战场，所以委员长给的二十个保安团，宁志远打算全部按照正规军编制来组建，只是在炮兵数量上略少，每个团的人数在两千人左右。
除上述各部外，另组建有一个未公开的军事情报处，军事情报处有生化特工三百余人，普通人约一千余人，目前主要活动在西北、华北，慢慢会延伸到华中、华南，乃至整个种花家、全球。
照这个编制的话，新二军及保安司令部总兵力将达到二十万人，而宁志远目前只有生化士兵三万余人，完成整编俘虏、起义部队一万五千余人，未完成整编俘虏及起义人员约两万，招收新兵一万一千人，即使这些人俘虏、起义人员和新兵