其后，接踵而上。陈明遇大声呼喊，士兵们用长枪刺落清将，余者皆退下。
清军数日攻城不息，江阴军民浴血抵抗，力保城池不失。他们还把庙里的神像抬上城墙，在上面张了黄盖，抬着巡游各处。以磁石捻动神像胡须，遇到铁器，胡须就会自动关闭；用机关扶住神像的手动作，使得看上去像在指挥。清兵见之，恐惧万分，以为是天兵天将下凡。刘良佐让其子攻城，正当神像张开口，其子吓得胆战心惊，被义军士兵用箭射死。
二十八日，阎应元在守城战斗中，右臂被清军的炮火击伤。他包裹伤口后继续战斗，用左手握刀，一连砍杀了数个爬上城墙来的清兵。阎应元号令严肃，对苟且偷安、不守法纪的人，必然重加责罚，以警示众人，即使时士绅亦不例外。而当士兵受伤时，他又会亲自熬药斟酒，温言慰劳；当有人遇难，他亲自购置棺木，哭奠而殓葬；对义军士兵，不称姓名而称兄弟。阎应元凡事以身作则，诚恳待人，所以军民都怀德畏威，虽死不悔。
二十九日，清军再次攻打北城，被阎应元率军痛击，就转去攻打南城。清兵抢掠居民家中木箱千余只，在十方庵的后面叠成将台，高与城齐。清将登上高台指挥，其部将与亲兵围在台旁。接着调来百门大炮，对准城墙的东南角猛轰。顿时炮声震天，百里之外都能听到。一昼夜用掉火药一万五千斤，城墙几乎被轰塌。
阎应元来到南城，忽然看到清将站在高台上，正指挥清兵发炮。他立即让士兵们搬来一门大炮，对准高台安放好，装上了火药和开花弹。阎应元瞄准清将调整大炮，直到丝毫不差，便点火发射。炮声响过，清将及周围的近百个清兵被炸得不见踪影。
进入八月，清军久攻不下，博洛心中焦急，重新劝降，并使出离间、缓兵之计，皆被城中军民识破。摄政王多尔衮晓谕招安，言道：“明已亡，何苦死守？”博洛命人用箭射入城中。阎应元在信后补上：“愿受炮打，宁死不降！”射还清军。博洛大怒，令清军向城内发炮，城墙多处被损坏。
初八