陈炳焜为广西督军，这才合符他的心意。当时，护国战争结束，军务院也于7月14日宣布撤销。于是，陆荣廷率莫荣新、谭浩明、马济等军南下广东，围攻龙济光于广州，迫使龙济光退居琼崖，9月中旬解决了广东。就这亲，陆荣廷利用护国战争之机，控制了两广，成了西南地区炙手可热的一方军阀。
段祺瑞当政后企图统一全国,这样控制西南各省的唐和陆就成为他的巨大障碍.于是为了保存地盘,陆荣廷先宣布两广自主,接着又和唐又果断的打起了护法的大旗,邀请孙中山南下护法.1917年7月6日，孙中山与廖仲恺、朱执信等南下广州，联合滇桂军阀，举起了维护《临时约法》的旗帜。7月21日，北京海军总长程璧光和海军第一舰队司令林葆怿也联名通电，响应孙中山的护法号召，率舰队南下广州。8月25日，非常国会在广州召开，通过《中华民国军政府组织大纲》，成立护法军政府，选举孙中山为大元帅。军政府虽承认北京政府为在国际上代表全中国的中央政府,但是却不受其节制,在军政府的领导下,滇桂军阀同北方军阀展开了断断续续长达三年的南北战争.
1918年以后,南北战争进入了谈谈打打的阶段,陆荣廷为了巩固权力,就开始准备同北方和谈,接着他又于1918年4月10日，通过各种方法使非常国会通过了《修正军政府组织法》，改大元帅首领制为七总裁合议制，由唐绍仪、伍廷芳、孙中山、岑春煊、陆荣廷、唐继尧、林葆怿为总裁，旋即推举岑春煊为主席总裁。改组后的这政府完全由桂、滇军阀及其附庸政客控制，护法成为空名。孙中山见状，于5月4日辞职，5月21日离穗赴沪。该年5月陆荣廷突然下手除掉了入粤的滇军,此后他又急要剪除陈炯明、许崇智等粤军。
不想此时适值北洋军阀派兵从福建进攻潮汕，广东告急.早在护法军政府改组前，孙中山就想建立听命于自己的一支陆军，于是就和省长朱庆澜商量，拨出省长亲军中的二十营粤籍军队，由陈炯明率领“援闽”。桂系军阀对此事始则