灵目门共有十二个堂口。
首先是掌门真人培养亲传弟子的祖师堂，乃是所有堂口中条件最好的。
凡是被选进祖师堂的弟子，无不是资质绝佳、悟性非凡之人，或者为宗门立下了不世功勋，造化非凡之人。
同一时期的祖师堂弟子，一般不会超过五人，凡是入选者，几乎每一个在日后都取得了非凡的成就。
据说这一代的祖师堂内，只有两人。
这两人都是金丹后期的修士，在掌门真人闭关期间，成为了灵目门的所谓代掌门。
之后则是内门弟子所在的堂口。
分别为护法堂、执法堂、炼丹堂、炼器堂、制符堂。
这些堂口的条件虽然稍差，但各堂口的弟子们一般不会离开师门外出，能够享受到师门的各种便利，日常修行也不会因为各种任务被耽搁，乃是三年后学业有成弟子们的首选。
再之后则是外门弟子所在的堂口。
分别为特勤堂、聚宝堂、监工堂、四海堂、散叶堂。
这些外门堂口的弟子，常年被外派执行任务，经历各种危险，不仅无法享受到宗门的各种便利，外界的天地灵气密度也难以与清明山上相提并论，修行速度会因此降低许多。
这便导致外门弟子不仅无法养生提升寿元，本身的寿元也会因为各种日常伤势而有所流失，或过着日复一日的单调枯燥生活，属于三年后学业无成弟子们的无奈之选。
最后则是进修堂了。
进修堂可以说是灵目门的人才培养基地，也可以说是灵目门维护日常运转的后勤基地。
大量的低阶弟子，担任着灵目门底层的挑夫伙夫、守门道童、清洗除尘、房屋修缮、饲养灵禽、更换烛灯、打更报时等闲杂职位，以保证灵目门的井然有序。
而这些弟子通过劳动，可以提升对于师门的归属。
也可以到换取灵石报酬和师门贡献，再通过消耗师门贡献，获得旁听高阶修士讲道的机会。
三年时间过后