助防守漳州潮州。
抗倭援朝
万历二十五年，明，日和谈失败陈璘重新被启用统帅五千广东兵支援朝鲜。
万历二十六年，陈璘升御倭总兵官，与刘綎一起统帅部队，其部下驻扎在山海关时大闹，陈璘受到谴责。
不久命令他提督水军跟麻贵，刘綎以及董一元分路前进。领士兵一万三千多人，战舰数百艘分布在忠清，全罗，庆尚各海口。
陈璘水军成功震慑到倭寇，使日军不敢于海上行军。时丰臣秀吉病逝，日军大撤退。陈璘令部下邓子龙和朝鲜将领李舜臣于丰道上截击敌人，结果二人双双死亡。
陈璘又派陈蚕，季金率军支援，痛击倭寇，日军大败。这时刘綎才攻打小西行长军队，行长军退守顺天城。陈璘挥师西进，毁倭船百艘，斩溺倭兵百余人，将倭寇首领石曼子击败，生擒倭帅平正成，平正秀并处死。并与陆路明军夹攻顺天日军，取得了露梁海战的彻底胜利。
陈璘一生主要有三大功绩:一是平定两广的匪患并落籍粤西云安县时称东安县。
为当地的社会稳定，经济发展起到了开拓者的作用；二是统领水师抗倭援朝，尤其是露梁大捷一仗，明军大败日军成为亚洲海战史上着名战役之一，让日本此后二百年不敢觊觎中华。
三是平定播州叛乱，促进我国西南地区的经济发展和社会进步。
陈璘亲自指挥的露梁海战是一场以切断敌人海上退路为目的的规模巨大的海上歼灭战，被认为是亚洲海战史上之一。
这次海战给侵朝日军以重大打击，对战后朝鲜和平局面的形成起到了重要作用，经此大捷之后200多年日本不敢萌生侵略中国之念，而朝鲜亦得复国。
然而这样的英雄人物却被恶意抹黑，前有岳飞尽忠报图被奸臣，昏君以“莫须有”之名陷害而死，后有大明陈磷被抹黑，更气人的是朝鲜分裂成朝韩两国后，后世韩国抹黑陈磷比清朝有过之而无不及。
明朝嘉靖二十二年即1543年1月27日广东省翁