收复辽东之后，岳肃派大军前往曰本作战，德川幕府本就和吴思南的兵马，打了个难解难分，势均力敌，明廷援军一到，强弱之势，立刻明朗。
吴思南率军反扑，吴家省、邢鹰等总兵各个争先，打的倭人是落花流水。千叶距离江户很近，吴思南长驱直入，一直打到德川幕府的基地。德川家光看明军厉害，一方面坚守城郭，一方面派人与吴思南谈判，并遣人到其他地方，招募兵马，邀请别的大家族帮忙。
可是，吴总督对于痛打落水狗这种事情，是从来不会耽误的，现在想起来谈判了，早你干什么去了。直接将来使打发回去，下令继续进攻。江户也算是坚城，双方展开激烈的攻防战，明军炮火犀利，倭人的火力也算可以，就这样，整整打了将近半个月，明军才攻开江户。
大军进入城内，又展开激烈的巷战，直到最后，将德川家杀了个精光，战争才算结束。当然，吴思南杀光德川家的理由，很是光明正大，因为这是丰臣复业公子下达的命令，当年你们德川家将我们丰臣家杀了个干净，就留下我们一根独苗，今天必须要以牙还牙，绝不姑息。
就这样，德川幕府正式灭亡，那个所谓的丰臣秀吉的传人重新成立了丰臣幕府。战争告一段落，此次明军损失不小，本钱和利钱肯定是要收回来的。德川幕府的所有财产，全部被抄没，归大明所有，除此之外，吴思南还和丰臣复业签订了一系列的不平等条约。
大明朝出兵为丰臣家报仇，现在大功告成，丰臣家需支付大明军费，折合白银一万万两。没有足够的银子不要紧，曰本国可以先从大明朝的银行贷款，贷款不能没有抵押，可将九州和千叶抵押给大明。每年的利息，可用税收来抵偿。而且大明还要拥有在曰本的采矿权。
为了保证你们丰臣家的安全，维护我大明朝的威望，大明可在曰本设置驻军，部队数量随意，而这些部队的军饷，需由丰臣幕府支付。
条约一共二十多条，几乎是把大半个曰本卖给了大明。但这些对于一个原本就一无所有的