碇源堂和碇真嗣父子最后走不同的道路，碇源堂不断人类补完，碇真嗣不断重启。之所以父子做了不同的选择，主要还是因为碇源堂的目标是自己内心限定的小爱，只能在内心寻找幸福。
而碇真嗣的目标是大家幸福，这就不是说自己心里认为就够了。碇真嗣吃饱了，不能就认为别人也吃饱了，碇真嗣幸福了，不能就认为别人也幸福了，他无法依靠自己一个人完成目标。
因为目标不同，所以父子走了两条不一样的路。渚薰为什么阻止近第三次冲击？就是知道碇真嗣不会满足于自己和绫波丽过小日子的，他肯定会自责。
如果碇真嗣满足过小日子的话，tv版和旧剧场版里两次的补完，一次补完了自己，一次就剩下自己和明日香，但他都没有接受，而是选择了重启。所以就算碇真嗣从力天使里救出绫波丽，但如果真的发生第三次冲击，那么他肯定不会幸福。所以渚薰阻止了初号机，因为他要帮碇真嗣打出完美结局。
不过近第三次攻击之后，大地也全变红了，已经不适合人类生存，只有葛城美里等人使用净化仪器才能让小范围的土地恢复清洁。更可怜的是碇真嗣还成为了背锅侠，他怎么知道救绫波丽会导致冲击？他根本不知道，更不要说最后还没救出他熟悉的绫波丽。
对碇真嗣来说完美的结局并不是自己的幸福，而是大家的幸福。但这种结局太难了，最后他也只能选择了妥协，他无法把世界变成百分之一百符合自己的心意，那自己也只能退而求其次，改变自己。不去追求每个人的幸福结局，而是删除使徒就好了，剩下的就顺其自然。
删掉了使徒，那么世界也就变得平凡了，大家或许都能在平凡的世界中找到幸福。碇真嗣也不是救世主了，不会把自己的内心强加于社会之上，他不会成为父亲那样的大人。
其实杜兰觉得没有使徒的世界并不好，还是打使徒有意思。
“好了，就这么决定了，以后你和碇唯每年七夕可以见一面，其他的时间你就以普通人的身份活下去吧