情报和暗线事宜，知道的人非常少，而且都是秘密展开的，但其作用是巨大的，每次郑家军面临战斗厮杀的时候，情报的作用就充分体现出来了，有时候甚至起着决定性的作用。
郑勋睿决定正式成立情报署，直接归自身管辖，也就是说唯有他能够直接干涉情报署的事宜，其余人都不能够直接插手，情报署依旧归属于郑家军的建制，是为了战斗厮杀才设立的，这样对朝廷便于解释，至于说情报署的职责，自然也需要明确下来了。
大明王朝的情报机构，最为著名的就是锦衣卫和东厂了，不过这两个机构都是臭名昭著，满朝文武闻之色变，没有谁对其有好感。
不过锦衣卫和东厂的设立，其目的都是为了巩固皇权，镇压异己，其发挥出来的情报作用，主要也是为了监督朝廷官吏以及百姓，属于对内的情报机构，所以尽管锦衣卫和东厂的势力强大，几乎渗透到大明各地，但是对外部的情况一无所知，譬如说对后金鞑子和流寇的情报，根本就不知道。
郑勋睿要求正式成立的情报署，其作用就大大强于锦衣卫和东厂，情报署分为三大块，最为重要的第一块是对外的情报，包括后金鞑子、流寇甚至是海外的情报，第二块是针对朝廷以及地方相关的情报，第三块是针对内部的情报，包括淮北、蓬莱、复州和陕西等地的情报，三大块的情报综合起来，就是情报署所需要侦查到的事宜。
情报署的人员，主要是抽调郑家军斥候之中的精干人员，他们负责收集和整理收到的各种情报，并且进行综合归纳，甚至要提出相应的分析意见，情报署核心的力量是暗线，暗线组成的人员就非常复杂了，各色人等都有。遍布各地，他们是情报署信息的来源。
情报署设立专门的行动队，行动队的职责非常明确，遇到紧急情况采取相应的措施。保护漕运总督府以及郑家军的安全，行动队必须在接到郑勋睿的命令之后才能够行动。
郑勋睿很清楚，任何一个时代，情报署都不可能是光明正大的机构，很多秘密的事情。