却说西王母回到天庭后，便令百官各司其职，提拔亲信，排除异己，渐渐将昊天的权利都握到了自己手中，而昊天转世的人间界，此时却也是一片欣欣向荣。
人族历经天、地、人三皇的治理，生活水平有了很大的提高，不再是巫妖大战后那般的落后，渐渐呈现出大兴之兆，有了些天地主角的样子。
轩辕统治人族五十二年，根据日月星辰的移动规律结合自己所学著成《黄帝内经》一书，此书包括《素问》八十一篇和《灵枢》八十一篇，各有九卷。
此书一成，有神农氏自火云宫而来，告之其功德圆满，当将人皇之位传下，然后去火云宫清修，黄帝闻言大喜，便召集大臣，宣布让位之事，命众臣推举新皇。
有大臣推荐轩辕之孙颛顼，言颛顼少有贤德，可执掌人族，众大臣纷纷附议。轩辕听后点头应允，便命众人准备传位之事。
三天后，轩辕按前两任人皇的规矩先是祭拜圣师、圣母、太上老君，然后便在洪荒人族的见证下，将人皇之位传给了自己的孙子颛顼。
就在轩辕将人皇之位传于颛顼之后，伏羲、神农两位圣皇坐着龙辇从天而降，笑着对轩辕道：“恭喜皇弟功德圆满，证得人皇之位，可与我等同去火云宫修行。”说完便让出半片座位邀轩辕同坐。
轩辕行礼道：“劳烦两位皇兄前来，轩辕不胜惶恐。”说完便登上龙辇与伏羲、神农同往火云宫飞去。
就在轩辕登上龙辇的刹那，一道功德从天而降，同样将轩辕的修为提升到准圣后期。又有数十道功德落于洪荒各处，被当年相助轩辕的众仙所得。
由于缁衣氏不欲参与人族内斗，所以所得功德却是不及前两位帝师，在人族三祖中却是修为最低，只有准圣中期修为。
至于阐教十二金仙则是由于诛杀普通人族太多，不但未有丝毫功德降下，反而惹下了无边因果。
轩辕此次证道却是奉命将崆峒印与轩辕剑一起带走，只将九龙星辰冠传下，自此三皇时代结束，人族步入五帝时代