南、贵州一带仍然忠心于明朝的土司联络，相约共同抗清。
吴三省明白，昭宗皇帝父子已经被杀，必须树立起一杆抗清复明的大旗，才能激励士气，为成大事做基础。吴三省与汪公福、祁磊等人商议，共同推举明朝宗室后裔朱红珍为大明王，建年号洪兴，以1662年为洪兴元年。在勐朗坝建立城堡，城堡内建立了简易的宅院做王宫和官府机构。
洪兴元年（1662）十二月，朱红珍在勐朗坝称大明王，以吴三省为大将军兼兵部尚书，主管军事政务，汪公福为内阁首辅兼吏部尚书，主理朝政。
此外，祁磊为户部尚书，靳统武的侄子靳泰为刑部尚书，刘文秀的养子刘鼐为户部尚书，吴三省的侄子吴国安掌管禁军。改称勐朗坝为兴朗城。
洪兴七年（1668）二月，吴三省率军二万人出师北伐，在宁洱击败清军，占领了宁洱城。四月，又向昆明推进。六月同清军激战，互有胜负。七月，在距离昆明城不足七百里的一个叫来巴山的地方，清军将明军围困。吴三省率军苦战，士卒死伤大半，被迫杀出一条血路逃走。清军在后边紧追，明军占领的地方又被清军夺去。
九月，吴三桂派军向兴朗城进发。十一月，双方在兴朗城二百里外的山林里激战，清军由于不熟悉地形，被打的惨败，狼狈逃走。吴三省纵军追击，又中了埋伏，战败后逃走。
这一仗，双方均没占到什么便宜。吴三省明白，这个时候还不是与清军算总账的时候，以明军的实力还难敌清军，只好继续执行休养生息政策，等待时机。
而吴三桂此后忙于应对清朝廷的削藩，加上他也知道兴朗的明军不过是一支明朝的漏网之鱼，兴不起多大的风浪，所以也就抛往脑后了。
洪兴十二年（1673），吴三桂公开反清，掀起了三藩之乱。吴三省明白，这是复兴明朝的好机会，于是带着那喜烈的子侄那和、那庆等人，在第二年春上出师北伐。
1674年三月，明军被仇视那喜烈的几个土司包围，吴三省身中毒箭