十二月二十七，魏君重率部由九江西进，兵逼武昌；同时，岳州的征朔军。荆州新成的讨朔军，以及长江水师，一并向武昌压去，合击已被孤立的这一清军集团。
十二月二十九，闽省灭朔军兵出分水关。由苍南、平阳、瑞安直取温州；靖海侯邓耀率分舰队开至温州外海，并于温州以北的乐清佯攻登陆，予以配合。
永历十七年，康熙二年，公元1663年一月二日，镇海伯杨彦迪、建平伯郑缵绪率两千余艘战船由崇明出动，直入长江。在南通江面。破朔军借船南渡长江，水陆大军直指清军第一道江防——江阴。
一月五日，明军进至江阴，清朝文武官员凭城扼守。明军水师先破江上工事，然后驶近城池予以炮轰，破朔军趁势猛攻。江阴小县，一日而下；八日，明军进抵瓜州，阵斩清游击一名，败敌满汉兵马数千。炸断拦江铁索，摧毁锁江防线“滚江龙”，焚毁清军江上浮营（又称木城）三座，使清方苦心经营的江防工事全部瓦解。同一天，明军攻克瓜州，清操江巡抚投降。
一月六日，西路明军一改几日来不急不缓的推进速度，昼夜倍道，兼程而进，直逼安庆。而作为奇兵突出的一部明军骑兵，事先化装成清兵模样，由高得捷率领，先于大军诈开城门，安庆清军惊慌失措，在敌情不明的情况下，数千之众竟出东门仓惶而逃，安庆乃下。
一月十日，西路明军正继续东进，已有芜湖等地官绅派人送来密信，通报纳降归附的消息；明军以不足一千的骑兵先行，于一月九日收复芜湖；一月十日，长江水师一部冲破武昌江面，前来会合，并通报武昌正被三路明军围攻，城内清军有弃城北窜的迹象。
一月十一日，明水陆大军在镇江银山大破清江宁派来的援兵，清镇江守将与知府献城投降。十三日，先锋舟舰已进抵南京城下。
一月十五日，明军西线军团于当涂与东线哨船会合，从而基本上形成了东西会师，截断长江，合击南京的战略意图。
从攻克南昌到东西会师，不到一个