明清战争似乎演变成了战略相持，特别是西南，更为明显一些。云南、四川、广西，再加上鄂西、川东的夔东十三家，贵州的水西，战场虽呈分散化，但明军却有呼应之势，而清军却乏进攻之能。
有关吴三桂假书信的事情一出，清廷更是大为不安，深恐局势糜烂，不可收拾。因为，目前西南最强的军队便是吴三桂所统率，如果他反叛清朝，与明军合兵一处，则滇、黔不保，连四川、广西也没有足够的兵力能够抵挡。
但相信吴三桂，还是怀疑吴三桂，目前的形势下都不宜轻易处置。清廷不想逼迫吴三桂，可也要做出预防的措施。所以，一边下旨安抚吴三桂，一边在钱粮上加以控制，另一边则做出相应的兵力调动。
东西两线作战的不利和危险被清廷重视起来，是西攻东守，还是东攻西守，清廷终于做出了选择。
西南为南明朝廷所在，各地抗清武装奉为正朔，且大有兴复之势，若不尽早除灭，恐各占领区亦将人心不稳。
从这一点来看，清廷的认识还是很清醒的。目前的南明控制区仅仅为西南一隅，清廷占领区的人力、物力、财力都极大地超过对方，如果进行持久战，南明的压力显然会更大。
但惟有一点，清廷无法与南明抗衡——这就是人民的向心力。在多数人眼里，南明是承继明朝三百年统治的正统汉族政权，而清朝是茹毛饮血的野蛮夷狄。烧杀抢掠，无恶不作。大规模的战争、武力高压并不能使广大汉族人民屈服，尤其是民族气节坚定的高尚分子。不断绝人们心中的寄托，或者不经过一定时间的进化、蜕变乃至融合，反清气氛不会很快消散，占人口绝大多数的汉族人民不会口服心服。
另一方面，由于常年的战争，导致了经济凋敝，清廷财政困难。支撑两线同时作战也力不从心。权衡之下，清廷做出西攻东守的策略，并不出乎意外。
至于东面的郑成功，清廷则决定实行大规模的强制迁徙濒海居民的政策。迁海这一场以极其野蛮的方式摧残沿海居民的骇人听闻