究药理、毒剂的化学结构。
野口班（斑疹伤寒）：研究斑疹伤寒。肥之藤班（炭疽）：研究炭疽。碇班（炭疽）：研究炭疽。在田班（x光）：研究x光等其他放射线。特别班：负责特别秘密监狱的管理和实验动物的培养。
这些班就如同实验室里的各个科研小组一样。都有自己的科研项目和研究领域。彼此间还能互相交流和借鉴。最为现代化的生物细菌及病毒研究所。也不过就是在这些科研组的项目上，增加了几个内容而已。就如安布雷拉分布在世界各地的研究所，又如同高飞自己正在不断扩张的马达加斯加科研基地。
不过，731部队的这16个班，试验用的活体，只有少量的白鼠、马、狼等动物，大部分的活体试验对象，都是人类。而且几乎全部都是活人。他们被日军的其它部队以及731部队下属的各个特殊部队抓捕偷运到特殊监狱中，然后迅速被转入到各个班的实验室中。
这些活人们被731部队的成员称之为“圆木”（丸太），活体试验也被日军暗称为“马路大”，此项作业的要点是：必须保证解剖对象是绝对清醒的状态，也就是说，绝对不能麻醉。因为日本军医认为麻醉后的研究数据是不真实的。其解剖场景惨绝人寰。解剖时，那凄厉的惨叫声是常人所无法想象的。此项工作也是731部队所有医师所必备的基础技能。
除了对这些活人进行“活体解剖”，还有各种各样的试验方案。许多试验方式就是高飞这个芝加哥大学医学系的博士都猜想不到的，可以说只有日本人才能有如此超越正常人的思维，设计出如此毫无人性可言的研究方案并加以执行！
在这些资料数据中。许多数据都是独一无二的，因为许多试验项目都是见光即死。不可复制的类型。比如说手榴弹试验：用人在不同的距离和位置进行手榴弹试验。这可不是仿真人，而是真正的活人。
此外，还有冻伤试验：将活人直接锁拷在零下温度的冰室内，观察活人在冰冻条件下的肌肉和皮肤、内脏等器官的坏死状况