两位新人加入了军械库，除了伽古拉假扮的蛇仓队长，也认识了另外的几名队员，新手驾驶员夏川遥辉，王牌驾驶员中岛洋子，以及科学顾问大田结花。
星野远回想起之前的测试，门口的招待小姐姐，以及味道奇怪的果汁，正是大田结花和她的杰作，询问之下他才知道，自己是被当成了果汁味道的试验者。
军械库特空机的队员们，跑到了实验场地测试机甲，夏川遥辉和中岛洋子，分别驾驶着两台机甲，特空机一号赛文加，特空机二号乌英达姆，大田结花负责监测数据，星野远和美剑纱织，也被安排到现场观摩学习，只有蛇仓队长留守在指挥室。
赛文加和乌英达姆战作一团，蛇仓似乎是接到了异常信息，经过观测设备分析之后，竟然是传说中的吉尔巴里斯，由外星种族制造出来的人工智能，却因为自我意识的提前觉醒，认为只有消灭所有智慧生命体，才能实现宇宙的永久和平。
吉尔巴里斯通过包裹星球，能够将其完全转化为数据，捷德奥特曼曾经与其恶战，变身终极形态将其消灭，没想到今日又重新复活，伽古拉对此也是极为重视，吉尔巴里斯即将降落的位置，正是测试机甲数据的实验场。
“所有人员，立即撤离！”，蛇仓队长即刻下令，然而却是为时已晚。
正当大家还没有反应过来时，星野远和美剑纱织严阵以待，他们已经发现了高空的敌人。
“远、纱织，负责疏散人群，洋子、遥辉，准备进入战斗！”，蛇仓再次命令道。
紧接着敌人突然降临，吉尔巴里斯现出原形，好在蛇仓队长的及时告警，远和纱织井然有序的疏散人群，洋子和遥辉驾驶着特空机甲，却根本不是吉尔巴里斯的对手。
吉尔巴里斯，有着高度人工智能，它控制遥辉的赛文加，瞄准洋子的乌英达姆，释放出硬芯铁拳弹，致使两架机甲无力再战，只能任由敌人猖狂下去。
天空再次降下一道光团，现身后竟是一名奥特曼，指挥室的蛇仓无