天文十四年（1546）年3月30日卯时初刻，泷尾神社。南军的先锋第一次遭遇了抵抗，这场举世瞩目的京都合战的第一枪也在此打响。
「一番是我们织田家的了！是我织田信长的！」织田信长披坚执锐地亲临一线，不由分说地抢在众军之前，率先点燃火绳、扣下扳机，将铁炮的弹丸射向了泷尾神社。在织田军对面，是打着丸三柏旗号的三村军，总兵力不过2000人左右，不可谓不孱弱。但即便如此，拿下了这等荣誉，还是令织田家的士兵们兴奋不已，大呼酣战地向泷尾神社内涌去。
与此同时，北条军则向东北方向的智积院进发。然而，智积院的守军一色军居然草草抵抗就行就撤退了，直接向北转移到了新日吉神宫。毕竟对一色家而言，非亲非故甚至属于敌对派系的三村家根本不值得他掩护。这下就把三村军的侧后暴露在了北条军面前，如果三村军不撤退，很可能会被迂回包抄——到了那个时候，作为先锋的织田军、北条军和斋藤军可就不会留手了，肯定发了狠地打三村军。只要把三村军歼灭了，这么多的俘虏和军械肯定能补上损失。
于是，三村军也只得同步撤退，向北转移到了三十三间堂。由于京都地区林立的街巷，根本没有大片的平地可供追击，让撤退的三村军可以借助巷战从容地且战且退，在没有遭遇多大损失的情况下就转移成功。
与此同时，西进的朝仓军和六角军也已经抵达了东山桥一带，开始做渡河准备。沿途的百姓不是早已逃难，就是紧闭门窗躲在灶台后，不敢发出一点声响——百余年来饱受劫难的京都百姓，仿佛已经进化出了应对兵乱的能力。
天文十四年（1546）年3月30日卯时四刻，北条军整顿后再次北进，追击一色军而去。与此同时，斋藤军也进驻了泷尾神社，接替了织田军的驻守，腾出手来的织田军再次北上，进攻三村军的新阵地三十三间堂。
另外一边，朝仓军和六角军确认了河对岸没有埋伏后，纷纷向西渡过了鸭川。六角军进驻了长福寺，随后