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永历帝入住贡院，视朝听政，任命扶纲、雷跃龙为内阁大学士，张佐宸为吏部尚书、王应龙为工部尚书，成立兵部、刑部、大理寺、詹事府等官署，以黔国公沐天波执掌朝廷禁军。封李定国为晋王、刘文秀为蜀王、白文选为巩国公，其他将领亦有封赏。原先卖身投靠孙可望的司礼监太监庞天寿、锦衣卫马吉翔已为朝廷所不容，庞天寿服毒自杀，马吉翔被靳统武拘禁。马吉翔诡计多端，乞怜献媚于靳统武，为晋王歌功颂德，终于得到李定国的信任，重新入阁办事。
在昆明安定后，永历帝立即派白文选和张虎为使者，携带玺书前往贵阳，劝说孙可望消除隔阂，重归于好。临行前，朱由榔赐张虎一枚金篦，叮嘱道：“卿等往道朕意，务使两藩复敦相好，事事为祖宗社稷起见，卿等功名垂竹帛矣。”李定国亦修书孙可望，劝他迷途知返，同心释忿，共济国难。后来又将孙可望家眷送往贵阳，可谓仁至义尽。但孙可望毫无悔改之意，一意孤行，反而欲图云南。永历帝不敢贸然行事，留李定国镇守云南，派刘文秀统兵数万，北上四川。
却说万云龙、葛明见云南大势已定，谢绝李定国的挽留，与蔡德忠、方大洪、马超兴、胡德帝、李式开东返。因广西大部分州县复又被清军占领，七人转走交趾，雨宿风餐，几经风涛瘴氛与虎狼之险，终于来到海港，搭乘一艘往铜山运送木材的帆船。郑成功在东山岛铜山设立造船坊，修造战舰和商船，所用坤甸木、菠萝格和柚木大多购自交趾。又经波涛汹涌的洋面，忍受着狂风暴雨，历尽艰辛，方才驶到铜山水城。
只见城墙全是用条石砌成，两丈多高，依山起伏，状若巨龙。葛明见城墙上放着数十门大炮，赞叹道：“延平王把铜山打造得城坚炮利。”万云龙骄傲地说道：“铜山城建于洪武年间，历来是海防要塞。戚继光将军在此屡歼倭寇，路振飞在海上两次击溃荷兰舰队。国姓爷加固了铜山城，清虏只能望城兴叹。”
进城后，七人拜访了主将万礼，讲了永历帝移驾昆明的经过