道，彼此截长补短，似乎已消除所有弱点。实际上，教会信徒绝对无法反抗的天使也能使用佛教与神道的术式与其战斗。
俄罗斯成教
专长幽灵狩猎的教会组织。向鬼火等现象当成是伪装人类灵魂的存在，尽管是真正幽灵也因为是罪人的灵魂，都毫不宽容的加以狩猎。本篇中登场的サーシャ＝クロイツェフ属於其中的特殊部队「歼灭白书(Annihilatus)」。具有能将心灵现像在现场以原本方式呈现的管理缩小再现设备。
科学势力
学园都市占据东京都的三分之ㄧ，居住着230万名学生的巨大都市。和外部隔离，研究最尖端科技。所有学生都接受超能力开发。此外，学园都市不存在警察，取而代之的是从学生中挑选出的风纪委员(Judgement)和教师自愿参与的警备员(Anti－Skill)。
时间守护者：表世界闻名的杀手组织，具体不明。
猎犬部队(HuntDog)
アレイスター直属的学园都市地下组织。使用嗅觉感应器追杀目标。首领为木原术多。
SkillOut
学园都市无能力者的武装集团。大多是翘课不去学校和夜间行动的家伙
科学结社
学园都市的外部组织。和天井亚雄与结标淡希勾结，企图利用结标取得树形图的设计者残骸并加以复原。
虚数学区五行机关(PrimaryKnowledge)
一般被认为是学园都市最初的研究所，谣传是暗中统治学园都市的组织，外部教会和魔术师则认为是亚雷斯塔居住的『没有门窗的建筑』。实际上是230万人份能力者放出之AIM扩散力场重叠而成的存在，因此控制非常困难，目前谁也无法操纵。威力会因为一定威力的冲击爆发性成长，但临界点、方式与规模尚未明白。本不会思考也没有意识但在亚雷斯塔的故意引导下产生了意识，即风斩冰华。亚雷斯塔想利用这制造“人工天界”。
关