除部队抗争。它们相信总有一天，能够重建光之城。现在，龙野剑和北岛亚美正是被带到了这里。
可惜秘密基地不可能永远是秘密，在削除部队几乎地毯式的搜查之下，只要妖精兽和玄内等人不能坐视村子里的幼年期、成长期数码兽被削除部队欺辱残杀，它们就不得不暴露自己。
龙野剑也由此真实感受到了数码世界面临的动乱，有了拯救数码世界的想法。在爆发数码之魂救下妖精兽后，他和北岛亚美告别玄内，踏上了拯救数码世界之路。
“这样就能拯救数码世界吗？”玄内目送龙野剑离开的背影，其实发展到现在，数码世界许多地方自有主宰，暴君国度、天使国度、东方大世界雄踞一方，早已不是那个勇者杀魔王的单调世界。巴尔巴兽虽然篡夺了伊古德拉希尔的权柄，却小心翼翼到连自己的真身都不敢暴露，生怕须佐之男兽和暴君天使兽x会来请它喝茶。
“数码世界最深切的灾难即将降临，《数码兽启示录的预言每一条都已应验。我们只能选择相信剑，集齐八枚数码记忆体与主电脑，数码世界才能拥有未来！”妖精兽沉重道。
龙野剑搭乘机车兽，根据“乘客的意志”铺设铁轨，向着玄内推荐的另一个拥有数码记忆体的数码兽——超比多兽所在的北方森林而去。而与此同时穿过大草原的加门健太郎和奥加兽为了返回暴君国度也在向着北方森林赶去……
美国，沃利斯和八神嘉儿通过一系列拦车行为，经过一天一夜的行程终于赶到了沃利斯小时候居住的小镇。在小镇外的湖边找到了记忆中的花田。期间他们数次遭到云迪兽的攻击，每次都是在灰色的气流中忽然出现，在经过激烈的战斗后又忽然消失。而在战斗的过程中，大耳兽为了保护沃利斯成功进化为了加鲁哥兽。
另一方面，本宫大辅听说了八神嘉儿的情况后急吼吼地要过来，最终与汤岛浩一起乘飞机赶往美国。
当这所有人陆续赶到花田，云迪兽出现了。它静静地站在沃利斯面前与他对视。七年过去，两人的外貌都