在被值班太监当场抓住，朱常洛才算躲过一劫，一个农民如何能闯进戒备森严的皇宫，又如何能轻易找到太子居住的宫殿，看来此中必有内情。
经过反复审理，案情牵涉到了郑贵妃，但没有进一步追查，两个太监做了替死鬼，此案草草结束。不过究竟此案是否为郑贵妃指使，没有定论。此案成为了明宫三大案之一。
不管如何，万历四十八年，朱常洛历尽千辛总算登上了皇位，成了君临天下的帝王。在他即位的前十几天，朱常洛进行了一系列革除弊政的改革。他内帘搞劳边关将士。虽则杯水车薪，也是万历朝很难见到的。他罢了万历朝的矿税。这种税收曾一度使民不聊生，叛乱叠起。他拨乱反正，将由于进谏而的罪皇帝的言官都放了出来，恢复了官职。面对万历中后期官员严重不足的情况。他重振纲纪。提拔了一批新的官吏，补足了缺额，使国家机器能够正常运转。
正当百姓望治之时，皇帝却突然病倒了。什么原因呢？泰昌帝未即位的时候就好几。即位之后郑贵妃不知出于什么目的。向皇帝洪献美女乞猜曰帝的身体本来就不好，年龄又不饶人凹岁，即位之初处理政务非常繁忙。加上回到后宫的纵欲，他终于到下了。
本来不是什么大病，吃几副补药。静心调养一段时间因该可以复原。但是掌管御药房的太监崔文升向皇帝进了一济泻药，泰昌帝当天晚上腹泻三四十次，身体一下就垮了下来，再也起不了床了，而且病情日趋恶化。
就在这时，鸿驴寺承李可灼进献两粒红丸，泰昌帝用了第一粒后后，病情稍见好转，用了第二粒后泰昌帝昏昏睡去，于第二天清晨驾崩。由于皇帝服用红丸毙命，红丸到底是什么药，是否有毒，崔文升为什么要向皇帝进泻药，这些都已无法弄清，这件事史称红丸案，此案最后不了了之，成为了明宫又一大案。
泰昌帝就这样不明不白地走了。没当皇帝之时处处小心，当了皇帝没几天又抱憾而终。生前命运坎坷。死后陵寝也是采用当年景泰帝的废陵，命运对帝王竟也如此捉弄。