眼看福建形势翻覆，清朝浙江福建总督陈锦赶紧向北京发出求救奏章：“我国家定鼎以来，干旄所指，无不披靡，未有如建宁之贼死守难攻者。类而推之，可知闽省之贼非懦弱而易剿者。今建府一城之贼虽除，其余属县以及延平府属漫山遍野，无处非贼。若福州以上各府尚梗阻无耗，见在侦剿，大约处处皆然也。况漳、泉逼临大海，犹贼类出没之乡；江西见在叛逆，更贼党通联之处。故闽省虽云已入版图，较之未入版图之地，尤难料理。”
到七月间，多尔衮也有些害怕了，一连派出济尔哈朗、谭泰两路大军，都还没有捷报传回，现在福建又闹起来了。看来江南无宁日了。于是，先告诫陈锦，“贼势盛，宜死守不攻。则贼内乱必起，待援军至，里应外合，福建可定矣！”
其后派遣礼部侍郎陈泰为靖南将军，率领梅勒章京董阿赖（即东阿来）、刑部侍郎李延龄以及李率泰、济席哈、祖泽远诸将统兵南下福建，配合浙闽总督陈锦大举反攻。
事情确实被多尔衮料中了，虽然几路大军围攻福州不下，但各处清军悉数龟缩城中不敢出城迎战，外部环境的宽松，内讧的苗头就又露出来了。
郑彩的拥戴鲁监国，原本就是希望重演郑芝龙操纵隆武帝于股掌之上的故伎。见大势一定，郑彩迫不及待地开始夺权了。六月十七日，他悍然击杀大学士熊汝霖。义兴侯郑遵谦愤慨不平，郑彩又命部将吴辉诱擒杀之。鲁监国对郑彩的跋扈自雄、擅杀大臣极为不满，当他得知熊汝霖、郑遵谦遇害后，大怒曰：“杀忠臣以断股肱，生何益耶？欲跳水死。左右与彩力劝止，遂究首谋十余人磔之”
而此时，郑彩的异军突起让郑成功也害怕了，害怕这位表哥做大了再夺取自己的郑家家主的宝座，于是想趁着建国公郑彩引兵福州，蒲田只有郑彩之弟定远侯郑联据守的机会，袭取之。但厦门到蒲田，近五百里之遥，还隔着清军据守的泉州，如之奈何啊？
得知此事的施琅一拍大腿，道：“这有何难？以亲亲通好为名，挑选二千精锐押着一千