铖进京后发觉接受魏忠贤的安排迟早出问题，于是很快又辞官回家了。
真论起来，说阮大铖是阉党真是冤枉他了，他从没帮魏忠贤对付过东林党，只不过是魏忠贤帮他得到了一个本应该归他的官职。
但东林党不管这些，崇祯登基后，诛魏忠贤，定逆案。凡涉入逆案官员，终生不得录用，很不幸，东林党没有忘记阮大铖，把他列入了逆案名单中。
崇祯八年，阮大铖避战乱来到南京，经常召些游侠谈兵说剑。
吴应箕，冒辟疆，侯方域、顾杲、杨廷枢、黄宗羲等等，东林旗下子公司复社成员，他们继承了先辈丰富的斗争经验，和比狗还灵敏的政治嗅觉。认为阮大铖召些游侠来谈兵说剑必有阴谋；
你一个逆党，你有资格谈兵说剑吗？
首先，你抢了我们的风头；
其次，你是不是想通过此举，表明你对边事很熟悉，好教皇帝以边事召入朝啊？
于是，这些脑满肠肥的富二代立即群起而攻之，作《留都防乱公揭》，说阮大铖：“其恶愈甚，其焰愈张，歌儿**充溢后庭，广厦高轩照耀街衢，曰与南北在案诸逆交通不绝，恐吓多端。”
公揭写成，复社一百四十多人签名，将阮大铖赶出南京城。
好吧，阮大铖歌儿**充溢后庭，诸位公子哥儿家里有多少歌****就不说了，清溪白石，名**悠游，这些总是大家看得到的吧。
说阮大铖与诸逆臣南北交通不绝，诸位公子结党复社，成员愈万，这又怎么算。
说阮大铖恐吓多端，你们呢，贴公揭驱逐，连城也不让进。
这是典型的只准州官放火，不许百姓点灯。阮大铖被逼到这分上，心里当然大恨。
但他非常清楚，自己势单力薄，要反击，只有入朝掌握大权才行。
这些年他一直努力研究兵书战法，一面积极活动，首辅周延儒第一次被罢免时，阮大铖就敏锐地觉察到周延儒的价值，于是开始烧周延儒这口冷灶，投入大量财力和人力，