象吕大器这些官员，纷纷朝南京奔去。
国不可一曰无君，很显然，摆在留守诸臣面前的首要任务是拥立新君，重新组织**。
南京一时风云际会，暗流激荡，各部官员为拥立新君一事奔走忙碌，公私合议，一时却难有定论。
按照父死子继的历来传位程序，当然首选崇祯的儿子来继位。崇祯皇帝共有三个儿子：太子朱慈烺、二子定王朱慈炯、三子永王朱慈炤，但是这三位皇子都身陷燕京，下落不明。
大明朝如今风雨飘摇，急需一位君主出来充当精神领袖，不可能等找到崇祯的儿子后再立新君，就目前的情况议立新君只能从近支藩王中考虑。
按成例，挑选的规则一般是按血缘远近来考虑。光宗、熹宗都没有子嗣存世，那便只能从神宗万历皇帝这一代来考虑了。
和崇祯血缘比较近的藩王中，福王朱由崧是万历皇帝的亲孙子，另外还有他的几个叔叔辈的亲王，惠王朱常润、瑞王朱常浩、桂王朱常瀛，这三人是万历皇帝的儿子。
而潞王是万历皇帝的侄子，血统稍远。
但是，就当前的形势看，惠、瑞、桂三王都在自己的封藩，距离南京都很远，来回要好几个月，拥立他们没有实际**作的可能姓。
落实到可行的层面上，南京的官员们把目光都投向了不远处的淮安。本来拥立朱由崧是不应有争议的。
但在这国难当头的时候，东林党人却不忘去翻旧账了，正所谓做贼心虚，东林党人想起了当初的三大疑案；
这三大疑案虽然没有确切的证据证明是东林党炮制的，但东林党利用梃击案打击了朱由崧的祖母郑贵妃，使老福王朱常洵失去了继承皇位的可能。
红丸案中，更是直指郑贵妃指使人给光宗皇帝下毒，进而把郑贵妃逼入了冷宫。
有这些旧事在，东林党人担心朱由崧继位之后，会找他们算账，于是乎，本来理所当然的事情变得诡异莫测起来。
这时在籍的礼部侍郎、东林党大佬之一的钱谦益