浅海藻类植物260余种，以褐藻、绿藻、红藻、石花等为优势种群。
动物资源
保护区内动物可分为陆生动物、海洋动物2大类。①陆生动物。以鸟类为主，共有19目50科240余种。按生活习性和特征主要分为游禽、涉禽、梦禽、攀禽、鸣禽5类。其中国家Ⅰ级重点保护动物有9种，包括金雕、白肩雕、白尾海雕、丹顶鹤、白鹤、大鸨、白鹳、黑鹳、中华秋沙鸭；国家Ⅱ级重点保护动物有42种，包括雀鹰、松雀鹰、赤腹鹰、苍鹰、蜂鹰、鸢、白头鹞、白尾鹞、鹊鹞、灰脸鵟鹰、乌雕、草原雕、秃鹫、兀鹫、鹗、红隼、燕隼、游隼、灰背隼、红脚隼、猪隼等；《中日候鸟保护协定》规定种类有196种；“世界濒危动植物红皮书“中所列濒危鸟类有11种。岛上栖息鸟类多达5万余只，有“万鸟岛“之称。此外保护区内还分布有大蟾蜍、青蛙、峡口蛙等两栖类；蜥蜴、壁虎、蛇等爬行类；剌猬、蝙蝠、鼠类等哺乳类。②海洋动物。包括鱼类、海洋哺乳类、底栖类等类别。其**有鱼类21目72种，中华鲟、文昌鱼为国家重点保护种类；共有海洋哺乳类91种，包括鲸鱼、海龟、海狗、海豹、江豚等；共有底栖生物227种，以刺参、皱纹盘鲍、栉孔扇贝、虾夷扇贝、光棘球海胆等为优势种。
长岛省级自然保护区成立于1982年，1988年晋升为国家级自然保护区。保护对象为猛禽类。保护区总面积为50.15平方千米。长岛又称庙岛群岛，庙岛群岛湿地被列为中国重要湿地。保护区属暖温带季风大陆性气候区。年均气温11.9℃，极端最高气温36.5℃，极端最低气温3.3℃。年均降水量567毫米，降雨年际变化大，年内分配不均，59%的降水集中在夏季，年日照时数2554小时，无霜期243天。春秋季多西南风、西北风，夏季盛行东南风，冬季以西北风为主，全年风速大于17米/秒的大风天有68天。
长岛又称庙岛群岛、长山列岛，海岸线长约146千米，呈现明显的海蚀地貌景观，沿