加低落，伤亡也急剧增加。
29日，已经登陆了大半主力的东岸军队在星子县以西与清军遭遇。可怜这偷渡的一万多清军皆轻装疾行，一路上抛弃了大量辎重，此时正是疲累欲死的阶段；而好死不死的是，他们这上万人因为军情紧急还分做了三拨，第一拨迎头撞上的仅仅只有四千余人……
虽然炮兵主力已调到了南昌，但好整以暇的东岸大军以逸待劳，黑八旗、陆军火枪手、挺身队第二大队等精锐尽出，一战摧破此股清军。毙伤俘达两千余人。溃散的清军跑得漫山遍野都是，东岸人也懒得去抓，而是顺手拿下已开城请降的星子县，一边休整一边准备拦截剩下的偷渡清军（也不会忘了搜罗人口）——当然如果遇到数万人的清军大队顶多骚扰牵制一下，硬仗是不会打的。
31日，在又击溃了一支南下的三千余人的清军后，东岸军队也已搜罗到了七千余人口，然后在星子县湖岸边展开了繁杂的转运工作。这个时候，经过近四天时间的猛轰，南昌县城墙及城内建筑已多处坍塌。郭升派出万余精锐杀进了城内并控制了相当部分城区，耿仲明部死伤惨重、指挥混乱，他本人带着核心兵马数千人退守府衙一带，做困兽之斗。
8月3日。孔有德率领的大军出现在武宁县一带，而郭升下令用降军做先锋，不计伤亡猛攻南昌府衙，关键时刻甚至下令纵火焚烧民宅，终于在战至傍晚时分彻底攻克了这片区域。最后时刻，耿仲明率亲兵千余**溃围而出。被乱箭射杀当场，其部属欲降未果，尽被诛杀。一代汉奸带着两万残兵困守南昌城，前后竟然只坚持了12天即城破身死，落得此等下场，也是可怜可叹。
8月5日，此战亦伤亡颇大的郭升（前后伤亡达二万五千余）下令撤出已有疫病苗头的南昌城，然后率先后汇集过来的近五万人马北上建昌县，已打出些凶性的他们，打算会一会孔有德的六万大军（收拢了部分渡江零散清军）。孔有德在湖北厮杀多年，深知顺军的战斗力远不是明军可比，故在闻知耿仲明已败亡后，即刻下令就地停驻，