1647年5月30日，在得悉海军炮艇送来的清军最新动向后，莫茗不再迟疑，准备见好就收，开始率军进攻靖江东面的如皋县，准备顺着长江一路杀到黄海边上去。
此时扬州府的清军已经在石廷柱的调度下渐渐集结在了扬州、泰州一线，兵力已达二万之众；此外，淮安府亦有少数兵马南下，这个消息是从被东岸斥候截获的一名清军信使那里拷问来的，但具体数量不知，似乎是马队；而坐镇南京的洪承畴闻知漕运不通、水师损失惨重后，不敢白天组织人马渡江，而是在夜晚从南京上游往北岸的江浦县分批渡了三万人马，其中满洲八旗兵近五千人，不可谓不重视江北严峻的局势。
这三万人马渡江后，东岸人便失去了他们的踪迹，不过可以想象得出他们会先前往高邮州、泰州一带就食。如今江都、扬州一带已让东岸人抢成了一片白地，短时间内根本不可能供养得起数万大军的消耗，因此他们势必会前往这两地获得补给，然后才能尾追东岸大军。
至于另一路从淮安府南下的清军，目前根据东岸人掌握的情报，其主力似乎还在海州、沭阳一线，只有区区四千余绿营筹集完粮草而先期渡过黄河南下，但离长江的距离还很远。总之，清军似乎是准备从西、北两个方向进行重兵围剿，一如一年多前一样。战线漫长、兵力吃紧的他们始终无法拿流动作战的东岸大军有什么办法。
陆军撤离后，装满了银子、粮食、牲畜和部分人员的18艘中型渔船在四艘风帆战舰的护送下。拔锚，顺着水流离开了靖江江岸。进入黄海后，她们便升起了风帆。然后在东南风的吹拂下一路向北而去，她们的目的地是黑水港。至于剩下的9艘蒸汽机帆船、4艘运输船，则仍然在靖江以东江面至出海口附近游弋，且不时派遣炮艇送人上岸与陆军取得联系，以不断确定各自的方位。
6月2日，舍去大批辎重轻装前行东岸大军迅速进展至泰州如皋县城下。在发了数发炮弹后，如皋城内发生变故。团练首领带着数百名乡兵擒杀了要坚持抵抗的县令。