夜晚，米花综合医院，有个黑影悄悄潜入了医院，在药房中偷了一瓶氰化钾。柯南的病房813，柯南没有睡着，还在想事情，阿笠博士和千钧、灰原都曾经再三叮嘱过，变小这种极其夸张的传奇，不能告诉任何人。而平次认为小兰在等他的坦白。柯南又想起，新弗尼号上，小兰曾经说过，，小兰刻意强调，显然在那时她就知道自己的真实身份了。柯南摇了摇头，“看来，我只有说了呢。”
枪栓拉动的声音响起，灰原出现在床边，手中的枪对准了柯南的额头。柯南冒汗，“灰原……”灰原冷冷道，“真是不好意思啊，看来我的身体里，仍然跟他们一样，留着残酷的黑色血液。”柯南大惊，“什么？”
灰原道，“难道你还不懂吗？我的真实身份，已经被揭穿了，也就是你口中所说的黑衣人士。你应该很清楚的，就是当初在杯户饭店的那一次。我做梦都没想到，那时候除了匹斯可之外，会场上竟然还有他们另外的成员。其实组织就是听了她的话，才开始怀疑我很有可能被药物缩小了。而且，今天早上，组织的人已经找到我那里去了。我本来以为他们会立刻杀人灭口，没想到他们说，只要我回到组织，这次背叛的事情就当做没发生过。理由是自从我离开组织后，aPTX4869就此停滞不前的研究，必须由我尽早开始展开。”
柯南叫苦，“所以说，你就来杀害我这个知道组织存在的眼中钉了。这么说的话，你是千钧儿时的玩伴，也是骗人的了？”
灰原道，“对。一个偶然的机会，在美国我认识了千钧那位跟我同名的女朋友，从她那里知道了千钧的事情。后来我去你家里调查你失踪时，又发现了你和千钧竟然是搭档。我从组织逃出来后，必须要找到一个肯收留我的人，千钧儿时玩伴的身份，可以打消你们的戒心。果然，千钧很轻易就相信了我就是他儿时的女朋友，毕竟十多年没见过面了。”柯南咬牙，“可恶，果然是这样，我一直在怀疑……”
灰原冷笑，“杀掉你们两个，是组织愿意重新接纳我所提出来