怪兽宇宙世界，这个世界在数年前发生了一件震惊全球的事情，从海底中游出的哥斯拉在世人面前解决了天敌穆托，哥斯拉的出现让世人真正的明白这个世界并不是属于人类的。
泰坦巨兽早在数千万年前就生活在地球上，根据帝王组织的观察，他们所能在地球上发现仍存活的泰坦巨兽就足以接近二十头。
但就在不久前，一个来自于外星的怪兽王者基多拉在南极被别有用心的邪恶组织唤醒，察觉到基多拉苏醒的哥斯拉赶至南极，与这个外来物种展开了大战。
基多拉与泰坦巨兽不同，泰坦巨兽的存在对地球会有益处，但基多拉则是会摧毁地球的一切，哥斯拉是以守护地球自然而存在的，这一战无法避免。
刚苏醒的基多拉虽然还未完全恢复巅峰实力，都依旧跟哥斯拉打得有来有回，在一番交战后基多拉放翻了哥斯拉后振翅离去。
邪恶组织再次唤醒了位于墨西哥的马拉岛的炎之恶魔拉顿，熟睡的拉顿被吵醒后显然有些起床气，直接对着岛上的一切大肆破坏，接连前来迎击的战斗机群也被拉顿接连干翻。
就在拉顿大显神威之时，王者基多拉赶到了这里，拉顿丝毫不惧迎面冲了过去，就仅仅是三两下被基多拉跟打趴下了。
哥斯拉再次赶来交战，一个突袭将在低空中飞行的基多拉给抓到海里，就在两头巨兽交战的时候，向来热爱作死的美军投放了研发出的新型大规模杀伤性武器。
可结果就是哥斯拉硬吃了这一发直接蔫了，游回了位于海底深处之中哥斯拉一族的神殿遗迹中默默沉睡养伤，而基多拉则是屁事没有，扇扇翅膀飞走了。
这下好了，地球上能够抗衡基多拉的哥斯拉萎了，基多拉一声王者咆哮唤醒了地球上的泰坦巨兽们，让他们往他所在的城市赶来，并沿途不断的破坏城市。
而此时我们的骷髅岛靓仔呢，当然不是在骷髅岛上疯狂打野发育啦，而是和成凯的召唤兽沃利斯正身处在地心世界里。
原来就在基多拉苏醒不久