最后竟然演变出九黎这等强大的存在，后来巫族九黎统领蚩尤竟再次和人族争夺主宰之位，狠狠的给圣人们上了一课。最后蚩尤虽败，却给人族种下了痛恨巫族的种子。
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从此，巫族和妖族一样，成为了人族的生死大敌，尤其是近年，人族日益强大，领地不断扩张，竟找到了巫族残余栖息的部分部落。人族本着发现一个，弄死一个的原则，将一个个巫族部落无论男女老少，统统杀个干净。
如此多次后，终于惹怒了云游的共工，久不出世的共工发下天罚，一时间天降暴雨，持续数月。最后还是圣人出身，狠狠的警告了共工，暴雨才逐渐停止。只是根源虽止，但洪水之势却也形成，引得无数生灵涂炭。
此时的人族正是五帝中的尧帝在位，尧帝老迈，身体已经大不如前，正在物色下一任人皇，忽闻洪水滔天，大祸降临，本就老迈的身体更是摇摇欲坠，垂泪悲呼：“嗟，四岳，汤汤洪水滔天，浩浩怀山襄陵，下民其忧，有能使治者？”
众人皆推荐崇伯鲧，崇伯鲧临危受命，开始治理水患。崇伯鲧心想：“息壤者，言土自长，故可堙水也”，故而焚香祭天，从女娲娘娘处借来九天息壤，四处堵住水患。开始时虽见成效，但水却越堙越高，历时九年未能平息洪水灾祸，尧帝为平息众怒，将崇伯鲧处死在了羽山。鲧死了，但大水还是要治理，禹便接了父位，继续治水。
吴明下山之时，尧帝已禅让于舜，洪水依旧凶猛，外加无数饱经风霜的巫妖二族族人兴风作浪，洪水更有愈演愈烈的趋势。事态至此，圣人们终于坐不住了，无数圣人弟子下山，或是助大禹治水，或是斩妖杀巫，一时之间，人界却也是热闹非凡。
吴明因为闭关，错过了许多时日，故而他出关之后，女娲娘娘第一时间便让他下界整顿妖族。