历史上吴有性写出温疫论的背景是崇祯末年的大瘟疫，那场瘟疫全国横行十户九死，河南、河北、山东、浙江等人口聚集区，“五六月间，一巷百余家，无一家仅免，一门数十口，无一口仅存者”。
一些学者认为满清能够成功入关也和这场大瘟疫不无关系，起义军反复骚扰几遍都还没有崩溃的河南河北，清军一到却几乎是望风而降，以大明的情况再怎么样溃败的也不会那么快，如果真出现了死亡率这么高的瘟疫倒是比较能够解释。
当时的医生用治伤寒的方法医治全部失败，医生旁皇无措，吴有性也终于悟出不能全信古书的道理，写下“守古法则不治今病”的判断，开始研究当时的瘟疫之症，从头摸索出一套新的治疗方案。
后世学者考证认为这场瘟疫其实就是鼠疫，而且还是海外输入的新品种。随着隆庆开海，大量海内外交流自然会带来新的传染病。有港口的诏安突然发生前所未见的瘟疫也不是怪事。
王文龙也不知诏安流行的究竟是什么病症，但是他却知道控制传染病的最佳办法。
王文龙引导说“先生不如试用实验之思维，虽然诏安大疫，但总有一些人能够幸存，先生可仔细回忆，其中有无地方幸存者特别多，他们又和别处有何不同”
王文龙说道“这也算是一种实验，只不过是多场实验同时进行，有人染病有人幸存，幸存者聚集之处多半因为他们做了什么可以避免染病的办法。”
他这话一下提醒了吴有性，吴有性皱眉思索“诏安有海港，港中多是青壮，但即使如他们也多有染病的，可见此病厉害，并非身体强壮便能逃过一劫。”
想着想着他突然说道“如此说来倒有一处地方，那是诏安县一处名为洋尾的村子，我回莆田时经过此村，发现村中几乎无人染病。”
“此村可是在诏安外围”
吴有性摇头说道“地虽偏远但不是人迹罕至之处，诏安有条东溪，溪水在县界分成东溪干流和支流浒溪入海，洋尾就在两溪夹角处，村中常有人