空木博士是城都地区有名的宝可梦博士，在游戏中，空木博士是大木博士的晚辈。他的研究课题是“宝可梦培育与宝可梦的蛋”，皮卡丘居然有进化前形态也是他第一个发现的，蛋群也是他研究出的。此外也研究宝可梦的特性和进化，大木博士曾称赞空木博士是宝可梦进化的顶尖研究人士。
虽然是这么说，实际上空木博士在所有游戏版本的宝可梦博士之中属于是那种没有什么特点、很容易被人遗忘和忽略的那种。他研究宝可梦培育和宝可梦的蛋，但是在游戏中，他并没有对玩家进行这方面的指导，在游戏里面唯一和宝可梦的蛋有关的事情也就是游戏刚开始的时候，空木博士会让主角去宝可梦爷爷的家拿回来新发现的神奇蛋，因此把最初的伙伴交给了主角，并给出了自己的宝可装置号码。之后从空木博士的助手处获得调查过的蛋并孵化出波克比后，可把它带空木博士看他会送出不变之石。
直树和叶子进入了研究所，得知两人的来意后，空木博士非常热情地邀请两人住下，并且用研究所里面的仪器为两颗未孵化的宝可梦蛋做了全面检查。他能这么热情也是多亏了大木博士，空木博士是大木博士的铁杆粉丝，对直树和叶子热情应该就是所谓的爱屋及乌。
说起来现实中的空木博士和游戏里面的很像，他是一个研究狂，直树也能够理解为什么在游戏中他和主角之间的互动很少了，毕竟忙成这样，也不太可能给其他人太多的关心，光是顾着家人就不错了。空木博士的研究所旁就是他的家，他的妻子和孩子一起住在那，他的孩子长大后想像他的父亲一样成为宝可梦博士。同样身为宝可梦博士的儿子，直树心里可一点这种想法都没有，只能说这孩子还太年轻了。
两人在空木研究所停留了几天，帮助空木博士研究的同时也从他那里学到了不少关于宝可梦培育的知识。直树才发现空木博士还有话痨的一面，说起有关研究的事情的时候，他总是能够说个不停。
另外，经过这些天的孵化，直树和叶子从正辉博士那里得到的宝