还没下完农耕这盘棋，朱植又开始同时谋划辽东军事改革这盘棋。
回广宁城后，他陆陆续续和张石分享了自己想进一步进行军事改革的想法：
“这次辽东主力远征哈拉温山以西，准备捕鱼儿海会战，其实是对辽东明军远征作战和后勤保障能力的一次综合检验。”
“尽管会战还没开始，已经提前暴露出一年来辽东军训练和战备方面的不足。比如，兵器配置不合理、过分依赖火器、没有充分发挥冷兵器的优势，从指挥员到战斗员都还不适应极寒天气下的特别作战等等。”
“特别是小哈拉章率一千精骑打穿明军的后勤补给线，全歼火真护送的运粮分队，消灭了驻守双辽的骑兵，甚至直扑广宁城。教训极为深刻。”
“如果不是当时魏二狗等人故意引错路，不仅在黑山一带屯种的移民可能会受到灭顶之灾，甚至连广宁城也会措手不及。这后果至今想起来还是让人觉得一阵阵后怕。兵圣曾说：‘兵者，死生之地，存亡之道，不可不察。’此言不虚也。”
“根据后世的记载，这次捕鱼儿海会战将以明军大获全胜而结束。会战之后，散落在漠北和哈拉温山一带的蒙古黄金家族势力将一蹶不振，短期内很难纠集大股兵力南下进犯，上万兵力的大兵团作战可能性并不大。”
“但是，如果遇到天灾，还是会有小股蒙古人南下冒险打劫。随着蒙古、女真等各部落势力重新洗牌，他们的内部争斗也会牵扯到周边驻防明军和屯民。”
“因此，我们要适应东北局部安全形势的变化，推进辽东明军军事转型建设，把军事改革当成一个常态，既要能够应对大兵团作战，也要能够应对随时可能发生的小规模冲突。”
“我们先订一个小目标吧，就是进一步改进部队体制编成，既能随时遂行营以下小规模特种作战任务，又能加强东北的重点目标、重点区域和重点方向的防护。”
“就目前而言，辽东军事力量部署的重点目标就是长春，必须充分保障明军在长春屯垦开