大明与南下清军大战结束后，以黄河为界，明清双方进入停战期，正当周鉴准备改革制度，提高综合国力之时，于永绍元年元月，全国各地爆发大大小小的瘟疫。
尤其是河北、河南一带出现瘟疫最为严重，很多逃难的百姓又将瘟疫传染到了南直隶。
永绍元年二月，京师南京这一天非常寒冷，街巷走动的人群非常稀少。
有几名百姓走在大街上，好好的人突然倒地抽搐，周围百姓见状，纷纷围了过去。
询问倒地的几个人什么情况。
众人虽然询问，但倒地的几个人除了浑身打颤，抽搐之外没有任何反应，很快便不省人事。
几个人虽然不省人事，但很快被家属找到，带回家中。
起初，京师南京的百姓并没有将此事当回事，结果，过了数日，那些家属以及周围的邻居纷纷出现类似状况。
而且之前，最先倒地的那几个人也都相继病逝。
不到半个月，整个京师南京各大街巷都出现类似情况，开始出现整户整户病倒，甚至整户病逝的情况。
有些百姓蹲在家门口，上午人还好好的，中午人便犯病过逝。
然而，人过世必然大操大办，结果传染的人更多了。
此事引起了南京府衙的注意。
府衙将此事上报给了摄政王府，周鉴得知，立马有了清晰的判断，这是南直隶传染了瘟疫。
周鉴以摄政王的名义，下令南直隶百姓居家隔离，不得到处走动，以防瘟疫传播失控。
起初百姓不理解，不配合朝廷的决议。
周鉴只能派人大量印发瘟疫病理，并贴在家家户户的门前以宣传。
并派出重兵巡逻，若发现百姓出门闲逛，立刻罚款。
同时给家家户户百姓免费发放麻布“面罩”，类似后世的口罩。
另外发放大量的活性炭，给百姓的井水消毒。
至于食品则由地方衙门统一采购，根据每家人口状况定额定量配置。