塞壬——在人类科技的巅峰时期所出现的一种不明类生命体，她们自深海中诞生，侵占属于人类的海洋，封锁人们通航的海域。她们，一度被认为是神话中“主”派遣来惩罚人类的神灵，直到“舰娘”的出现，人类才得以重回海域，各大洲域才打破了信息壁垒能够正常通航通讯。
在舰娘出现后的近百年里，人类携手舰娘建立了一套切实可行的指挥机构，由人类担任指挥唤醒新的舰娘并与之组成舰队、港湾，一同守护人类世界。
但是，人类并未全部信任这些有着独立思维意识，仅与指挥官保持着信任的舰娘们。为此，百余年以来，人类明修栈道、暗渡陈仓，费尽心思的在大陆中央秘密集结了各类顶级的科学家。不负众望，经过不计年月的研究与攻坚，在付出了无以计数的代价后，人类终于在大陆的深处研制出了对塞壬的最终武器——相位弹。
相位弹，这种依据超弦理论所制造的武器，其能够依据独特的能量相位形式破坏塞壬的防御护盾，而且在相位弹击破护盾后，其弹片也能够以其独有的物理相位形式破损侵蚀舰体，一经命中塞壬将无法完成自我修复。
□□□□年，人类在大陆某区域秘密引爆了相位弹，实验结果甚至超出了理论结果。参与实验的塞壬捕获体，其心核及舰体均受到严重损毁，最终被舰娘确认已完全死亡，无法在任何海域中复生。而作为秘密驻守的舰娘，也在人类的观测中被发现，其护盾在受到相位弹的能量冲击后，其护盾也会因为超弦干涉失去效果。这一重大突破，为人类反击塞壬带来了希望，也让人类与舰娘之间的关系产生了一丝动摇。
在此之后，随着人类对超弦理论的深入研究，相位弹技术不断成熟，弹体逐步小型化，于是人类开始将其应用于实战。
□□□□年，多个位于人类内陆的导弹基地开始被重新启用，随后在一个阳光明媚的白天，弹道导弹加载相位弹冲破了云层，向着海域中的塞壬展开了精准打击，这场精准的制导攻击被人类称之为“手术刀”。