朝臣们的反映，看来自己的威望足够，王谢两家子弟亦不敢作声。
接下来是把控朝堂，桓玄以总百揆的身份宣布，任命桓谦为尚书左仆射、中军将军，参掌尚书省，掌京中六军；桓石绥任黄门郎、左卫将军，守卫宫城；卞范之为建武将军、丹阳尹，负责京城四周军事事宜；王谧为中书令，领军将军、吏部尚书，执掌尚书省和百官选任。
王谧是王导曾孙，生父王劭，过继给伯父王协，与王珣是堂兄弟，王珣之父王洽与王劭等人是兄弟。
王谧为人圆滑，左右逢源，与皇族、各大门阀的关系都很密切。
桓玄之所以看重他，除了王谧出身琅琊王家，身份高贵外，便是看重王谧善长与人打交道，可替他缓和与世族之间的关系。
刘裕当年被刁逵绑于树上鞭打，便是王谧解救，王谧算是慧眼识人。
朝堂换成自己的亲信把持，方镇当然也要换上自己的亲信。
桓玄自领扬州牧；其兄桓伟进安西将军、由江州刺史改任荆州刺史，兼领南蛮校尉。
此次进攻建康，桓石生多次传递消息，居功甚伟，桓玄封他前将军、江州刺史。
桓修进右将军、都督六州诸军事、兼任徐兖二州刺史，许诺给刘牢之的青兖刺史成了空话。
雍州为杨安玄所夺，桓玄当然不会罢休，任冯该为雍州刺史，夺回襄阳。
朝庭授杨安玄为雍州刺史，都督雍、梁、宁、益四州军事，成为了桓玄的心病，宁、益两州毛家经营多年，又在偏隅，一时难以动摇，桓玄决定换掉梁州刺史郭铨。
此次进攻建康，苻宏劝降杨秋，表现出对
自己的忠心，桓玄将苻宏封为梁州刺史，让他配合冯该对雍州进攻。至于郭铨，桓玄决定调他返京，任前将军。
豫州刺史、谯王司马尚之兵败后逃往涂中，被人告发被擒，正押往京中。桓玄没有安排豫州刺史的人选，准备留与刘牢之。
里里外外安排妥当，天色已经不早，桓玄有些疲乏，准备前去休