这是一个人类都市与精灵秘境相融合的世界！
传说在三百年前，宇宙另一端的精灵宝可梦世界，遭遇了某种未知的末日剧变。
具有创世伟力的精灵【阿尔宙斯】。
打开了异世界的通道，将四分五裂的精灵世界，以【秘境】的形式，融入了海蓝星。
从此以后。
有着神奇力量的精灵，和属性各异的自然秘境，降临到人类都市世界。
因为对精灵超凡力量的恐惧，以及支配超凡魔兽的欲望。
人类发动了驯服精灵的漫长战争！
这场百年战乱。
最终在人类部落，发现了可以收服精灵的神奇树果后，拉下了帷幕。
此后。
可以收服精灵的精灵球，
收服精灵，并指挥它们战斗的人类训练家，
管理训练家们的精灵联盟，
以收服传说神兽为目标的邪恶组织……纷纷由此诞生！
而另一方面。
人类对精灵的研究和实验，从未停止。
林雷所在的这座岛屿。
便是位于东煌联邦，海外地区的【新岛秘境】！
据他所知。
一群来自海外的精灵学博士，正在岛屿上制造世上最强的人造精灵——
那便是传说中的基因之神，超梦！
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