就在第二次世界大战点燃战火的前一个晚上，十一区的冬木市进行了第三次圣杯战争。
七个从者和七位御主，为了实现自己的愿望而互相厮杀到最后一组，但途中却发生小圣杯灰飞烟灭的意外，圣杯战争本身在那个时间点就这么地告终了。
问题出在那之后，被藏匿在圆藏山大空洞的万能愿望机——大圣杯。
不知道命运是在哪里产生了变化，被支持以骨科闻名世界国家的魔术师发现了它，并借用军方的力量尝试将它移走。
尽管御三家爱因兹贝伦、远坂、玛奇里（间桐）三大魔术家族，与十一区官方为了阻止这项行动而奋战到底，但刚打完圣杯战争，无比虚弱的他们以失败告终。
集结三大家族所有力量和资源建构起来的大圣杯，就这样被外国势力给夺走了。
御三家的实力虽强，但毕竟人数稀少，并且对手可是一个国家的军事力量，其中还有效忠的魔术师等。
那场战争没有记载于任何文献，没有留下任何影像，甚至并不存在于人们的记忆之中，但毫无疑问是国家势力，与魔术师之间惨绝人寰的战争。
而正是由于这场战争，使得圣杯御三家就此退出舞台，就这么的消失在了历史的长河中。
那么，顺利获得大圣杯的国家，是否就能随心所欲地统驭世界了呢？
这样的未来当然没有成真，在外国势力运送回国的途中，大圣杯离奇地消失了，不管怎样，原本应该能实现统一世界梦想的大圣杯，没有落入任何人手中，就这样离奇的“消失了”。
就仿佛像是被安排好的剧本一样！
负责人更迭，关系人士被送上战场，原本应该是赢家的国家，也没有人知道大圣杯的下落──说起来，知道大圣杯这个存在的人类均不复在。
同时消失的，还有自称千界树一族的魔术师，也同样就此下落不明。
大圣杯消失了，御三家的梦想，或者说偏执，就这样梦碎的烟消云散，冬木市在和平安稳的状态下