崇祯六年四月，皇太极领诸贝勒百官出沈阳城十里迎接孔有德耿仲明，以女真人最为隆重的“抱见礼”相待。
五月，山西巡抚许鼎臣上疏奏明山西连年且流寇肆虐民不聊生，奏请减免山西赋税三年，正直朝廷刚查明各省欠缴盐课三百二十万两，绸缎数十万匹，勒令各有司限期补缴，朝臣闹哄哄争吵一番后，正为钱粮发愁的朱由检拒绝减免山西赋税。
当月，被皇太极赶到青海的林丹汗缺衣断粮，领五万蒙古骑兵于清水、横城一带入寇宁夏，明廷宁夏诸参将守备纷纷溃逃，林丹汗大军一路大肆劫掠，直逼灵州，贺虎臣领一千余骑驰援灵州，并四处出击，阻击小股蒙古骑兵，不幸被林丹汗主力包围，贺虎臣战死，其子贺赞领五十骑突围而出。
战报传到京师，朱由检又惊又怒，遂追封贺虎臣都督佥事，并将延绥巡抚耿好仁逮拿治罪。
五月下旬，援交总兵邓玘领两千川军与济源善阳山一带射杀紫金梁王自用，流寇遂推闯王高迎祥为义军首领。
六月，流寇兵分数路，一路于山西潞安府攻破平顺县，杀知县徐明扬，曹文诏率三千兵马疾驰平顺，大败流寇，并一路从太行山追出河南北部，于阳城、偏店一带杀得流寇连连败退。
另一路流寇于河南北部先攻破河顺镇，再破林县，又往南寇略辉县一带，进逼卫辉城，城内潞王告急，一日连发十数道急报四出求援。
因邓玘的川军离开四川已有数年之久，先是崇祯二年入京勤王，又于崇祯五年入登莱平乱，征战千里，早已思乡心切，登州孔有德之乱后，邓玘上疏奏请返还四川，朝廷不允，又命他入河北剿匪，虽在济源射杀王自用，但川军早已毫无战意，怨言不断。
当月，闯王高迎祥、八大王张秉忠和闯塌天刘国能合兵攻打磁州，邓玘领川军驰援磁州，高迎祥、张秉忠等却突然掉头攻打兵力较为薄弱的河南毛葫芦兵，邓玘又掉头驰援毛葫芦兵，结果于林县一带中伏，川军大败，参将杨遇春战死，川军死伤一千余。
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