崇祯年四月下时，因宣府总兵卢忠几次差人急报夷人进口，却连系何部落、数目若干、作何剿击、宣镇如何提兵堵御一应情形都没说明。
崇祯年五月初，兵部尚书张凤翼奉旨对卢抱忠进行申饬，并令他通行各堡万分戒备。
崇祯年二月中开始修建堡墙来，中间还有一些丁口到田地里干活，到了五月中时，靖边堡的堡墙终于筑成。
整个堡城周长约在六百多米，为传统的正方形，通体以黄土夯筑，不包砖。
堡墙的北部两端接着靖边墩的马圈围墙，
正好原来这个火路墩可以用来守望。同时南门外的瓮城也是筑好，还挖有一道深三米，宽六米的护城沟壕。
遗憾的是靖边堡堡外的较场，还有堡墙上的女墙城楼等设施还未修建，只得待秋后再来兴建了。而且林飞还盘算着以后在堡内建一些地道暗道。
成后，众人安全便有了保障，林飞现这密密夯筑的堡墙非常结实，由于还灌入一些桐油，他惊讶地估计这堡墙的坚固度甚至在后世的混凝土之上。
靖边堡的堡墙通高十米，大明各边镇的堡墙普遍是高六米到十四米，靖边堡墙高十米，算是中规中矩。
在靖边堡南端兴建的城门以石块砌成，被命名为“永宁门”，内门命名为“永泰门”。在堡门的正上端，
镶嵌着一块石匾，正中浅刻楷书“靖边堡”三个大字，大字左右两边竖向阳刻楷书，记载了建堡的时间，军将，工匠等事迹人物。
此时靖边堡有军户四百多，不过住在堡内还是宽松。
对这些新兵，林飞还是先让他们学习站队列队，为了更好的训练他们，
林飞抽选了原来一些老兵掺杂进来，以便更好地带动新人。
林飞现在战兵队中只有刀盾兵，长枪兵，火铳兵三个兵种。