柯南以及他所在的少年侦探团，还在上小学一年级。
因为他们身上关于时间有关的常识被修改的关系，所以他们丝毫没有意识到，曾经比他们都小一岁的间桐樱，现在已经正式上帝丹中学，成为了一名中学生。
这一次让柯南怀疑人生的双塔摩天大楼事件，他作为亲历者之一，如何不明白其中的蹊跷。
第三名死者，常磐美绪，36岁，常磐集团社长，一位具备出色业务能力和手腕的女强人。
就是她主导了全霓虹最高双塔摩天大楼的开发，并顺利完工，才会举行了邀请各界名流带来的开幕典礼仪式。
也是她邀请了毛利小五郎前来，毛利小五郎不仅带上了自己的女儿毛利兰和柯南前来，连带着少年侦探团的吉田步美，小岛元太，圆谷光彦也一起沾光前来。
第二名死者，原佳明，常磐集团专务兼游戏工程师，是一位非常难得的情商和智商兼具的高管，参与了双塔摩天大楼落地的项目。
但这只是原佳明明面上的身份，暗地里他还是黑衣组织的外围成员，是黑衣组织在常磐集团内部的商业间谍。
第一名死者，大木岩松，市议员，不过在当地却拥有比shi长都大的权力。
就是因为常磐美绪和原佳明成功打通 了他的路子，双塔摩天大楼才得以在这座城市落地，并成功开发。
死亡的三人都不简单，而整个事情发展的过程更是和剧情截然不同。
在常磐美绪死亡之后，柯南很快锁定了嫌疑人，知名画家如月峰水。
在被柯南麻醉的毛利小五郎给所有人表演了一次沉睡的小五郎经典推理场面之后，如月峰水道出了自己的杀人理由。
仅仅是因为双塔摩天大楼挡住了他画富士山的景色，他就将三人全部杀害。
没错，如月峰水一个人承担了三人的全部杀人罪行。
这让原本对于原佳明的死亡有些怀疑的柯南察觉到了其中的异常。
后来他通过原佳明死亡之时手上