内政治左右军队的大道理为借口，把军队统帅权从政府和议会那里拿过来。直接交给了天皇。这就是日本独有的“统帅权独立”
西南战争后，山县继续他的改革大业。1878年他设立了一个相当重要的军事部门——参谋本部，这可是日本军事史上的大事，“参谋本部”这个东西权力极大，直属天皇，可以直接指挥陆军，负责所有陆军作战计划的制定。对参谋本部来说，政府和议会算个鸟，不仅政府无权管它，它还可以操纵政府。后来日本怎么就变成了军人当政的军国主义国家去四处杀人放火？就这个“军部独立”给闹得，山县这厮“功不可没”！
山县那么卖力地改革军制为了啥呢？肯定是“强国”！那强了国之后干啥呢？明眼人都知道：侵略扩张！山县这个人对军制改革万分痴迷十分投入，对侵略扩张也是情有独钟竭尽所能。1889年他当上了内阁首相后就叫嚣“伸张国势”是最要紧的事，也就是日本得抓紧时间搞侵略。
为了实行自己的策略山下有朋请来的陆军大学导师是德国人梅克尔少校，因为之前日本人已经见识到西方人的厉害，为此积极地学习西方的知识，招收的学员都是毕业于陆军士官学校小服役2年以上、年龄三十岁以下的步兵、骑兵、炮兵和工兵中尉。这个招生方法和体制有三大隐患，一是梅克尔只是一个战术专新自己本身就读不懂克劳塞维茨的《战争论》，虽然他的战术课很成功，从地图到沙盘到现的都可困可点。但那也只是培养了一批团级水平的指挥官。导致日军单场战斗可以打得漂亮，遇到国家级战争必输无疑。二是招收的学生都是从陆军小学小估军中学、陆军士官学校一路考上来的学生，只有他们才能在陆军大学蚀的录取率中胜出。不过。这些学生从小就是在军队环境里长大，不了解社会，也不懂政治，学的是打仗，会的也是打仗，一旦他们走上领导岗位。又没有力量能制约他们的时候。他们能干出什么事情，那是可想而知的。三是陆军大学没有后勤补给科目，造成了日军后勤这一块的漏洞，在抗日战场上往往