经历一次重大失败后，人类阵营死守不出，甚至主动放弃一些较小的基地，盖亚阵营成员依然太少，无法派人去占据，倒是便宜了神灵阵营，不过，他们也只是派出几个神灵驻守，毕竟神灵阵营的人数也不算多。
短时间内，兰斯也没办法，只能努力恢复状态，让美狄亚积存魔力，能够再次积存足够的魔力的话，或许可以再次使用隆基努斯之枪，攻破大中型基地。
盖亚基地得以重建，腑海林.阿纳修也重新成长，依然作为主要防御手段，不过，与以前不同，它的核心进化为一个新的生命体，外貌看起来类似于人类女性，绿色的皮肤，蔓藤一般的头发，身体上穿着一些蔓藤，树叶构成的衣服，她能力就是培植、催生植物，依然能生产魔力果实。
这段时间，吉尔伽美什与恩奇都时常溜出去，鬼鬼祟祟的，直到有一天，他们带抓回来一名女性英灵和她的master，这个master兰斯还认识，竟然是间桐樱。英灵名为美杜莎，受到雅典娜的诅咒，有着相当悲惨的遭遇，在神灵的领地附近晃悠，多半是想要报仇之类的。
兰斯这下明白了吉尔伽美什的打算，他多半想对那些神灵下手，传说中他与神灵可是有相当大的仇恨。
吉尔伽美什不是想做，实际上他已经在做，当初得知隆基努斯之枪的复原与毁灭的力量之后，他想试一试隆基努斯之枪是否对神灵有效。
神灵具有强大的能力之外，许多都有不死性的特点，极难对付，吉尔美伽什对那些驻守小基地的神灵试用，发现朗努基斯之枪果然可以杀死……不对，不算是杀死，而是将神灵还原，成为原始的状态。神灵作为盖亚的触角诞生，还原之后，化为最初始状态，如果还是以前的世界，他们或许可以回归盖亚，现在的世界并且在圣杯战争期间，他们只能化为一股杂乱能量爆炸，也就相当于彻底死亡。
天之锁，吉尔伽美什最喜欢的一样宝具，具有神性越高的生命，越难以挣脱天之锁的捆缚，与隆基努斯之枪组合起来，对于神灵简直是